《自然通讯》刊登vns86com威尼斯城-【官网】钱海丰教授团队重大突破

来源:科研院 陈微微发布时间:2022-03-24
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抗生素耐药性及“超级细菌”被世界卫生组织认为是当今全球最大的健康威胁之一。针对细菌耐药性的机制研究和风险评估一直都是全球生物、医学、环境等交叉领域科学家们聚焦的研究热点。

vns86com威尼斯城-【官网】环境学院钱海丰教授团队分析了土壤、水体、城市建筑以及人体等多个生境中耐药基因的丰度及相关宿主菌株,建立了全球抗性基因风险预测的新策略,该研究成果以“Assessment of global health risk of antibiotic resistance genes”为题,于2022年3月23日被Nature Communications在线报道。

vns86com威尼斯城-【官网】钱海丰教授团队长期致力于环境耐药基因相关研究。在该工作中,团队通过对来自全球4大主要环境4572个样本的大数据分析,揭示了耐药基因在土壤、水体和城市建筑等环境中普遍存在,而且,环境中检出的很多耐药基因能够同时在人体中检测到。这一抗生素耐药基因的转移过程赋予了人类致病菌更强的耐药性进化能力。因此,如何全面准确地评估环境中耐药基因的风险变得至关重要。

该研究通过从公开数据库中获取的近3万个细菌参考基因组,定量了每个耐药基因的移动性与宿主致病性,并结合耐药基因在人体中的检出率、移动性、宿主致病性以及对应的抗生素临床使用量建立了耐药基因人类健康风险评估新框架,确定了每个耐药基因的风险值,对开发设计相应的检测手段、监管机制与治疗方案具有较强的现实意义。

该工作得到国家自然科学基金(21976161,21777144和41907210)资助,主要由vns86com威尼斯城-【官网】环境学院钱海丰教授、陆涛副教授带领博士研究生张振炎、张琦、徐诺寒等历时一年完成。浙江省微生物技术与生物信息研究重点实验室、浙江天科高新技术发展vns86com威尼斯城的王庭璋研究员团队参与该项目宏基因组原始数据分析。巴塞罗那自治大学Josep Penuelas教授、澳大利亚麦考瑞大学Michael Gillings教授也参与了该项工作。

文章链接:https://doi.org/10.1038/s41467-022-29283-8


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全球不同生境中耐药基因分布模式以及耐药基因环境——人体共享模式


耐药基因宿主的分布模式 耐药基因移动性与宿主致病性


耐药基因人类健康风险评估新框架及其验证


结合机器学习精准预测人类活动影响下全球海洋耐药基因风险形势


钱海丰教授(左一)指导学生


钱海丰教授团队



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